上海中科计算技术研究所成立于2003年, 是中国科学院计算技术研究所与上海市浦东新区政府合作成立的非赢利(NPO)型的科技和产业推进机构，是中科院计算技术研究所直属机构,是网络型研究所战略布局下7大分支机构之一。上海中科充分发挥中科院计算所本部在IT领域的系统性技术优势和创新能力，提供能够提升和引导当地主流经济自主创新能力的共性关键技术，成为浦东新区政府、中科院计算所和当地企业三者之间的中间件和产业推进器。

　　上海分所采用理事会领导下的所长负责制，理事长是中科院计算技术研究所所长李国杰院土。理事单位有：浦东新区科委、浦东新区科协、上海张江（集团）有限公司、中科院上海分院、中科院计算技术研究所。

　　上海分所下设所务办、研发部、ICT技术转移中心（上海）、孵化器管理办公室、AVS移动多媒体实验室、中科网通AVS工程（联合）实验室。